Egy bő generáció alatt a felére csökkent a református és a katolikus egyház létszáma Bázelben. 1980 és 2012 között a négy kiemelt felekezet egyikéhez sem tartozók aránya 25%-ról 45%-ra nőtt. A lakosság 16,5%-a protestáns, 15,3%-a katolikus, míg az ókatolikusok és a zsidók aránya nem éri el az 1%-ot. Bár a muszlimok aránya 9,3%-ra nőtt, arányuk az elmúlt 5 évben csökkenő tendenciát mutat, és a bázeli muszlimok sem tűnnek ki vallásosságukkal: csupán a 15%-uk aktív tagja az imaházakat működtető egyesületek valamelyikének.